本文標題："菌群中鑒別微生物-培養的細胞檢測顯微鏡"
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菌群中鑒別微生物-培養的細胞檢測顯微鏡
被鑒定為屬于未培養的古生菌，如ANME一2。這些菌周?chē)橇蛩猁}
還原菌群。這些工作為生物代謝中甲烷氧化提供了有力證據。雖然13c
標記參與甲烷氧化是可以斷定的并且靠SIMS分析已經(jīng)得到解釋?zhuān)焕?/div>
用加入標記的培養基其他形式的C代謝可能更難說(shuō)明。利用熒光標記的
寡核苷酸探針來(lái)研究細胞固定或雜交需要考慮外加碳源的同位素干擾。
單細胞同位素標記技術(shù)主要局限是它們只能提供可標記或可同位素
示蹤的培養基代謝信息。這不利于我們對整個(gè)單細胞代謝過(guò)程的描繪。
對于這個(gè)結果，兩種新的基于PCR的方法已經(jīng)得到發(fā)展，保證了復雜環(huán)
境樣本中單細胞基因內含物的分離。第一個(gè)技術(shù)是末端微流數字PCR配
合16S rDNA鑒定單個(gè)未被培養的細胞，并同時(shí)檢測這些細胞中的其他基
因。利用微流設備從復雜混合物中稀釋并分離細胞。這個(gè)分離步驟很關(guān)
鍵，分離出的細胞將分別作為多重復PCR反應的模版。雖然到目前為止
，這項技術(shù)只被用于將研究特定代謝基因與木養白蟻后腸中一種細菌的
聯(lián)系，但原則上，它能夠應用于任何基因與16S rDNA已鑒定的單細胞之
間。這項技術(shù)能分開(kāi)獨立應用于不同時(shí)期的細胞(在成熟，基因表達或
基因定位)研究中。而且，單細胞PCR的應用避免了PCR人為誤差，例如
擴增誤差和非設計性產(chǎn)物等。隨著(zhù)白蟻后腸的研究，相似的微流技術(shù)已
用于人類(lèi)牙齦縫隙中分離的微生物。在這項工作中，基因組從目標個(gè)體
細胞擴增，保證了它的基因擴增大于1000。隨著(zhù)單細胞基因組序列方法
的發(fā)展，未來(lái)會(huì )有更好的基因組技術(shù)出現。這項研究的有利之處在于它
能在復雜的菌群中鑒別出催化目標反應的微生物(例如，檢測特定功能
基因的出現)。在這方面它與同位素陣列或SIP相似，對于微流數字PCR
技術(shù)細胞作為區別實(shí)體信息被保存。
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