本文標題："微生物多態(tài)激光檢測儀分析圖像顯微鏡"
發(fā)布者：yiyi ------ 分類(lèi): 行業(yè)動(dòng)態(tài) ------
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微生物多態(tài)激光檢測儀分析圖像顯微鏡
另一種解析從DNA提取物擴增出的混合16S rDNA的方法是變性梯度
膠電泳(DGGE)，可以將同樣長(cháng)度僅有一兩個(gè)核苷酸差異的片段分離開(kāi)。
接著(zhù)用rDNA與已知生物的寡核苷酸探針在電泳條帶上以雜交的方式來(lái)鑒
定與探針成功雜交的相應生物。如果需要純化，電泳膠的條帶可以經(jīng)洗
脫，再擴增，確定他們的核苷酸序列。這些序列接下來(lái)可以到對應的數
據庫進(jìn)行序列比對來(lái)確定是否曾被報道。第二個(gè)主要的微生物指紋圖譜
技術(shù)是末端限制性片段長(cháng)度多態(tài)。t—RFLP通過(guò)限制性酶識別序列，它
根據特異性限制位點(diǎn)分解DNA分子。得到的片段按大小分開(kāi)。單個(gè)片段
的分離是由于PCR引物中的一個(gè)帶有熒光標記，當接近這個(gè)引物的片段
遷移經(jīng)過(guò)激光檢測儀時(shí)就檢測到DNA序列。雖然這是一種比較不同模版
的多態(tài)性的簡(jiǎn)便方法，但t—RFLP對于正確分析多態(tài)性差異還比較繁瑣
。另外，DNA微陣列將被用于一個(gè)環(huán)境樣本中微生物多樣性的快速評估
這種以16S rRNA為基礎的微生物多態(tài)性評估方法的重要前提是16S
rRNA基因存在于片段中，并且有時(shí)呈多態(tài)和單基因拷貝(Klappenbach等
，2001)。其他可能影響以PCR一為基礎的16S精確評價(jià)的因素包括，潛
在的基于膜分化耐受性產(chǎn)生的細胞裂解能力的不同對核苷酸擴增的影響
；細胞顆粒吸附或包埋在復合培養基中使其無(wú)法收集；共提取的污染物
可能妨礙下游程序，DNA剪切導致嵌合產(chǎn)物，
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